На сегодняшний день в ФИАНе существует несколько программ поддержки студентов МФТИ. Часть из них в большей степени связана с успеваемостью студентов и включает программу целевой поддержки студентов МФТИ, проходящих обучение на базовых кафедрах МФТИ при ФИАН и образовательных направлениях МФТИ, базирующихся в ФИАН. Данная программа проводится на конкурсной основе, распространяется на студентов 3 и 4 курсов и предполагает стипендиальную поддержку в течение учебного года порядка 20 студентов, достигших наилучших показателей в учебе и ведущих активную научно-исследовательскую работу. Ежегодный объем финансирования программы составляет 80 тысяч рублей на одного студента.
Совместно с МФТИ ФИАН реализует программу поддержки студентов 5 и 6 курсов, проходящих обучение на базовых кафедрах МФТИ при ФИАН и образовательных направлениях МФТИ, базирующихся в ФИАН. Данная программа предполагает стипендиальную поддержку студентов, достигших высоких показателей в учебе, в объеме 30 тысяч рублей в месяц.
Наконец, вне зависимости от успеваемости и ВУЗа, в котором проходит обучение студент, ФИАН в приоритетном порядке трудоустраивает молодых людей, достигших выдающихся достижений в научно-исследовательской работе и опубликовавших, самостоятельно или в соавторстве, статьи в научных изданиях. Сегодня уже более 10 студентов МФТИ и ряда других ВУЗов начали свою научную карьеру в качестве младших научных сотрудников ФИАН и их средняя заработная плата составляет 71 тысячу рублей в месяц.